Avaliação da Variabilidade Genética por Análise de ADN

RAÇA MERINA
AVALIAÇÃO DA VARIABILIDADE
GENÉTICA por análise de DNA
Maria do Mar Oom
Ovibeja, 25 Abril 2013
Variabilidade genética PARA QUÊ?
PORQUÊ?
1
Melhoramento Animal
VARIABILIDADE
MANEIO
INFORMAÇÃO
Melhoramento
Selecção
Alteração dos
valores médios das
características
desejadas
Objectivo:
Objectivo:
Caract. morfológicos
Caract. fisiológicos
Caract. etológicos
Selecção
intensiva
Cruzamento c/ raças
mais produtivas
AMEAÇA OU
EXTINÇÃO DE
RAÇAS
AUTÓCTONES
(Erosão da diversidade
genética)
Redução do efectivo
2
Conservaç
Conservação de raç
raças autó
autóctones
Caracterização genética por análise de
DNA COMO?
MOLECULAR GENETIC
CHARACTERIZATION
OF
ANIMAL GENETIC
RESOURCES
2011
3
2n=54
Aná
Análise de
marcadores
gené
genéticos do DNA,
espalhados pelos
diferentes
cromossomas
(estruturas de
organização do material
genético nas células)
Material
Marcadores genéticos analisados
(microssatélites)
Merina Branca (6 explorações)
N=50
Merina Preta (7 explorações)
F
M
M
N=50
F
Animais analisados
(fundadores)
http://www.xeneticafontao.com/eng/pruebalab.php?id=12
4
Metodologia
Extracção
DNA
PCR
(Amplificação)
Material biológico
diverso
Análise de
Imagem
Electroforese em sequenciador
Automático (capilar ou de placa)
Avaliaç
Avaliação da Variabilidade Gené
Genética
CP49
INRA049
60,00
50,00
40,00
BR
30,00
PT
20,00
10,00
74
78
80
82
84
86
88
90
92
94
96
98
100
102
104
112
126
128
130
132
0,00
> nº variantes
(alelos) (18/16)
50,00
45,00
40,00
35,00
30,00
25,00
20,00
15,00
10,00
5,00
0,00
BR
PT
134
136
140
142
152
154
156
< nº variantes
alelos (6/5)
5
Avaliaç
Avaliação da Variabilidade Gené
Genética
INRA172
SPS113
90,00
80,00
70,00
60,00
50,00
40,00
30,00
20,00
10,00
0,00
60,00
50,00
40,00
BR
PT
BR
30,00
PT
20,00
10,00
0,00
126
137
145
146
154
156
160
162
164
166
126
130
134
136
HSC
138
140
142
144
146
154
INRA023
25,00
30,00
20,00
25,00
15,00
BR
PT
10,00
20,00
BR
15,00
PT
10,00
5,00
5,00
0,00
0,00
263 265 267 269 271 273 275 277 279 283 285 287 289 291 293 295
192 194 198 200 202 204 206 208 210 212 214 216 218 220
Avaliaç
Avaliação da Variabilidade Gené
Genética
PE
PIC
0.666
0.676
Ho
0.685
0.699
He
0.707
0.714
0
0,2
0,4
0,6
0,8
PRETA
BRANCA
1
Nível considerá
considerável de variabilidade gené
genética
Algarvia
Badana
Galega Brag.
Galega Mirand.
Mondegueira
Churra Terra Quente
Assaf
25 MSats
6
Avaliaç
Avaliação da Variabilidade Gené
Genética
PE
PIC
0.666
0.676
Ho
0.685
0.699
He
0.707
0.714
0
0,2
0,4
0,6
0,8
PRETA
BRANCA
1
20 Mats
P.Russo-Almeida , 2007
Avaliaç
Avaliação da Variabilidade Gené
Genética
PE
PIC
0.666
0.676
Ho
0.685
0.699
He
0.707
0.714
0
0,2
0
0,2
0,4
0,6
0,8
PRETA
BRANCA
1
PE
Ho
He
PIC
0,4
Lusitano
0,6
Garrano
0,8
1
Sorraia
7
Avaliaç
Avaliação da Variabilidade Gené
Genética
Raça
FIS
M.Branca
0.021 NS
M.Preta
0.031*
Ligeiro indí
indício de consanguinidade na M. Preta
Algarvia
Badana
Galega Brag.
Galega Mirand.
Mondegueira
Churra Terra Quente
Assaf
25 MSats
P.Russo-Almeida , 2007
20 MSats
Distâncias gené
genéticas entre raç
raças
Fenograma construído a partir da distância genética DL pelo método Neighbour-Joining
20 MSats
P.Russo-Almeida , 2007
8
Estraté
Estratégia conservaç
conservação / selecç
selecção
SUBDIVISÃO DOS REBANHOS
FLUXO DE ANIMAIS
ROTAÇÃO DE MACHOS
DIVERSIDADE GENÉTICA
CONSANGUINIDADE
OBRIGADA
9