Localização genética Síntese Processamento Função das moléculas de RNA (tRNA, rRNA, snRNAs e snoRNAs) Localização e função das diferentes moléculas de RNA Organização genética dos genes dos tRNAs (E. coli) • Nos operões para os tRNAs, também há informação para genes estruturais Ex. operão tyrU tRNA tRNA tRNA tRNA EFEF-Tu • Genes para os tRNAs também podem existir no mesmo transcrito de genes para rRNAs ex: operão rrn t1 t2 P1P2 16S rRNA tRNA 23S rRNA 5S rRNA tRNA Processamento da molécula de tRNA No processamento de um precurssor dimérico de duas moléculas de tRNA, intervêm: - endorribonucleases (ex. RNase P) - exorribonucleases (ex. RNase D) - transferase tRNA nucleotidil Molécula de tRNA 80 ribonucleótidos Bases Raras (ex.) Inosina 5,6-diidrouridina (DHU) Aminoacilação do tRNA A aminoacilação do tRNA ocorre entre o grupo carboxilo COOH do aa e o grupo 3’- ou 2’-OH do nucleótido terminal (adenosina) Aminoacilação da molécula de tRNA Cada sintetase aminoacil tRNA é especifica de determinado aa 1- Activa aa 2- Ligação do aa ao C 2’ ou 3’ da adenina, estabelecendo uma ligação éster de alta energia Função da molécula de tRNA tRNAs isoaceitadores diferentes tRNAs com diferentes anticodões, mas que carregam o mesmo aa, logo reconhecidos pela sintetase aminoacil tRNA 61 codões, logo deveriam existir 61 tRNAs diferentes…, mas não é a realidade… Interacção entre codão e anticodão Wobble • Capacidade de um anticodão reconhecer mais do que um codão (mas não necessariamente todos) de um outro aa, devido a um emparelhamento não standard na posição wobble (3ª base do codão). Possibilidade de síntese de proteína com alterações na sequência de aa • Mas, devido ao código genético degenerado, muitas vezes esta flexibilidade não implica que se insira outro aa diferente (ex tRNA (UAU) de Ile (AUA)que emparelha com codão de Met (AUG). • Em bactérias existem 30 (a 50 tRNAs, pois varia de espécie para espécie), podendo emparelhar com os 61 diferentes codões. Exemplo de wobble Diferentes tRNAs que servem vários codões para a serina tRNA ANTICODÃO CODÃO tRNA1 3’-AGI-5’ + wobble 5’-UCC-3’ 5’-UCC-3’ tRNA2 3’-AGG-5’ + wobble 5’-UCA-3’ 5’-UCG-3’ tRNA3 3’-UCG-5’ + wobble 5’-AGC-3’ 5’-AGU-3’ Exemplos de wobble em bactéria anticodon CGG anticodon CGU codons GCC CGU codons GCA GCG anticodon codons UAI AUA AUC AUU Inosina é uma purina modificada que pode emparelhar com A, C e U RNA ribossomal (rRNA) Constituintes dos ribossomas Organização dos genes Síntese e processamento Composição dos ribossomas em células eucarióticas e procarióticas Composição dos ribossomas eucariótico e bacteriano Organização genética dos genes dos rRNAs, em procariotas Nos operões com informação para os rRNAs também há informação para alguns tRNAs 7 stable RNA operons (rrn) in E. coli Each operon contains genes for: - 23S rRNA (rrl), - 16S rRNA (rrs), - 5SRNA (rrf) and - tRNAs The functional cistron-like RNA sequences are separated from each other by spacer regions and are transcribed as one RNA, which is processed by RNAse III that cleaves at specific sites to produce intermediates of rRNAs and tRNAs rRNA 16S bacterianno Emparelhamento de bases que confere estrutura a rRNA 16S Posições dentro do rRNA 16S de E. coli que interagem com a proteína ribossomal 5S Organização genética dos genes dos rRNAs, em eucariotas Modificação química Processamento nucleolítico Praticamente metade do rRNA precursor é desprezado e degradado no núcleo Modificações dos precurssores de rRNA, pelos guide RNAs (snoRNAs) Isomerização Metilação . Os snoRNAS ligam-se a proteínas formando complexos designados snoRNPs. . As actividades de modificação podem ser realizadas pelas proteínas ou pelos snoRNAS. . Identificaram-se snoRNAs nos intrões de genes que codificam proteínas ribossomais