estatísticas f de wright

ESTATÍSTICAS F DE WRIGHT
Medidas de fragmentação
populacional
• A endogamia resultante da fragmentação
populacional pode ser usada para medir o
grau de diferenciação que ocorreu entre os
fragmentos.
• A diferenciação está diretamente relacionada
com os coeficientes de endogamia.
Estatística F
Endogamia na população total (FIT) pode ser
dividida:
• Endogamia dos indivíduos em relação às suas
sub-populações (FIS)
• Endogamia devido à diferenciação entre subpopulações, em relação à população total (FST)
O cálculo das estatísticas F:
• FIS = 1 – (HI / HS)
• redução de heterozigosidade de um indivíduo
devido à inexistência de cruzamentos
aleatórios na sua subpopulação - desvio do
HW dentro da subpopulação
O cálculo das estatísticas F:
• FST = 1 – (HS / HT)
• Índice de fixação:
• redução de heterozigosidade de uma
subpopulação relativamente à população total
– diferenciação genética entre subpopulações
O cálculo das estatísticas F:
• FIT = 1 – (HI / HT)
•
• redução de heterozigosidade de um indivíduo
relativamente a população total, tendo em
conta os efeitos da subdivisão populacional e
a inexistência de cruzamentos aleatórios nas
subpopulações - desvio do HW na população
total
AS ESTATÍSTICAS F DE WRIGHT
Número de indivíduos
Freq. Genótipos
A1A1
A1A2
A2A2
A1A1
A1A2
A2A2
POP1
352
63
12
0.824
0.148
0.028
POP2
312
77
27
0.750
0.185
0.065
HI (heterozigosidade média observada) = (0,148+0,185)/2=0,167
Hs (heterozigosidade média esperada HW) = (2pqPOP1+2pqPOP2)/2
Precisamos de calcular a frequência de p e q em cada população:
POP1  p = 0,898 q = 0,102 2pq = 0,183
POP2  p = 0,842 q = 0,158 2pq = 0,265
Hs = (0,183+0,265)/2= 0,224
AS ESTATÍSTICAS F DE WRIGHT
Número de indivíduos
Freq. Genótipos
A1A1
A1A2
A2A2
A1A1
A1A2
A2A2
POP1
352
63
12
0.824
0.148
0.028
POP2
312
77
27
0.750
0.185
0.065
• HT – heterozigosidade esperada para a população total HW;
• precisamos calcular a frequência média do alelo p e q na população
“total”
• (p1+p2)/2 = 0.871
• (q1+q2)/2=0.130
• HT = 2pq=2(0.871) (0.130)/2= 0.113
O cálculo das estatísticas F:
• FIS = 1 – (HI / HS) 
• FIS = 1 – (0,167/0,224)=0,25
• FST = 1 – (HS / HT) 
• FST = 1 – (0,224/0,113) = -0,982
• FIT = 1 – (HI / HT) 
• FIT = 1 – (0,167/0,113)= -0,4779
O cálculo das estatísticas F:
• FST < 0,05 indicativo de pouca diferenciação
genética
• FST > 0,15 indicativo de diferenciação genética
Diferenciação não é o mesmo que
distância
• Diferenciação - considera o modo como a
diversidade genética se encontra distribuída
dentro e entre as populações.
• Distância - considera o compartilhamento de
alelos e também as frequências alélicas
• Fst (medida de diferenciação) - mede a proporção
da variância total das frequências alélicas que
ocorre entre subpopulações - os efeitos da
subdivisão da população e a redução da
heterozigose de uma subpopulação devido à
deriva genética
Fluxo gênico
• Em população fragmentada  tamanho
fragmentos fixos e taxas iguais de fluxo gênico
(m), um equilíbrio entre deriva e migração é
alcançado, onde FST é:
• FST = 1/(4Nem + 1)