ALTERAÇÕES GENÔMICAS DETECTADAS POR

ALTERAÇÕES GENÔMICAS DETECTADAS POR MLPA, EM PACIENTES COM CÂNCER COLORRETAL
REVELA PERFIL DE INSTABILIDADE
1,2
Autores
Instituição
2
2
Mariana Rocha , Alexandre Torchio Dias , Evelin Aline Zanardo , Thaís Virgínia Moura Machado Costa
2
1
1
1
1
, Flávia Balsamo , Sandra Di Felice Boratto , Sérgio Henrique Couto Horta , Bianca Alves Bianco ,
1
1,2
Jaques Waisberg , Leslie Domenici Kulikowski
1
FMABC - Laboratório de Genética da Faculdade de Medicina do ABC (Av. Príncipe de Gales, 8212
CEPES 2º andar), FMUSP - Laboratório de Citogenômica da Faculdade de Medicina da USP (Av. Dr.
Enéas de Carvalho Aguiar, 155)
Resumo
OBJETIVOS
O câncer colorretal (CCR) é o terceiro tipo de câncer mais incidente em todo o mundo, apesar disso sua etiologia
ainda é pouco compreendida. A investigação da variação no número de cópias gênicas (CNVs), nesses casos pode
fornecer bases para o delineamento de um perfil genômico relevante para o diagnóstico precoce desses pacientes.
Esse estudo teve por objetivo investigar a presença de CNVs por meio da técnica de multiplex ligation-dependent
probe amplification (MLPA) em amostras de carcinoma colorretal.
MÉTODOS
Foram obtidas 16 amostras de tecido por biópsia de 8 pacientes com CCR, sendo 8 amostras neoplásicas e 8
amostras obtidas de regiões adjacentes. Também foram coletadas amostras de sangue de cada um desses 8
pacientes, para análise comparativa de CNVs. O DNA foi extraído utilizando o QIAamp DNA Blood and Tissue Midi
Kit (QIAGEN, Valencia, California) e investigada pela triplicata da técnica MLPA (MRC-Holland®, Amsterdam, The
Netherlands) com kits específicos para as regiões subteloméricos (P036 e P070). Os resultados foram analisados
utilizando os GeneMarker® software (SoftGenetics, LLC, State College, PA - www.softgenetics.com).
RESULTADOS
A técnica MLPA identificou deleções envolvendo os genes KDM5A (12p); TNFRS18 (1p); CTDP1 (18q); TRIML2 (4p);
IL17RA (22q); MTA1 (14q); GAS8 (16q) e duplicações concomitantes envolvendo os genes CHL1 (3p); PSPC1 (13p);
SOX12 (20p); SYBL1 (Xq); CDC16 (13q); PDCD6 (5p) e RABL2B (22q). Os resultados revelaram um aspecto
heterogêneo de anormalidades indicando um perfil de instabilidade genômica, e inesperadamente mostraram que as
regiões adjacentes também apresentam CNVs patogênicas.
CONCLUSÃO
De fato, as alterações em CNVs subteloméricas comprometem potencialmente os processos fundamentais que
controlam a estabilidade genômica, incluindo a replicação celular e a resposta normal aos danos no DNA. Nessa
perspectiva a aquisição de CNVs patogênicas pode interferir diretamente no mecanismo de reposta aos danos e criar
um ambiente genômico instável levando a progressão e ao aparecimento de outras neoplasias por um mecanismo
recentemente descrito, denominado “chromothripsis”, que associa os rearranjos em CNVs ao desenvolvimento do
câncer. A MLPA é uma importante ferramenta diagnóstica que permite melhorar a compreensão do perfil genômico
de CRC e outros tipos de câncer. No nosso estudo a MLPA identificou alterações genômicas patogênicas não
possíveis de serem reconhecidas na análise histopatológica de rotina ampliando a capacidade detecção para esse
tipo de amostra.
Palavras-chaves: câncer colorretal, CNVs, MLPA
Agência de Fomento: FAPESP, FINEP