Algoritmos de processamento digital de imagem para a contagem

Algoritmos de processamento digital de imagem para a
contagem de colónias de bactérias
Orientador:
Colaborador:
Augusto Silva ([email protected])
José Vieira ([email protected])
Licenciatura:
LEET
Nº alunos:
1
Enquadramento
A contagem de colónias de bactérias é uma tarefa monótona e repetitiva que
consome muito tempo aos biólogos. Hoje em dia existem sistemas comerciais que
auxiliam nesta tarefa sem no entanto extremamente caros estando portanto fora das
capacidades de grande parte dos laboratórios. Além disso, estes programas possuem
muitas vezes uma interface com o utilizador que não se revela a mais adequada,
levando a que mesmo os biólogos com acesso a programas de contagem prefiram
realizar o trabalho manualmente.
Objectivos
Pretende-se neste projecto desenvolver algoritmos de processamento de
imagem para a contagem de colónias de bactérias. Todos os algoritmos serão
desenvolvidos em Matlab sendo posteriormente as tarefas mais pesadas do ponto de
vista computacional passadas para linguagem C.
Tarefas
1. Levantamento dos programas de contagem de bactérias existentes no
mercado.
2. Desenvolvimento dos algoritmos de contagem de bactérias em Matlab.
3. Passagem das partes mais pesadas do código para C.
4. Validação dos algoritmos por comparação com contagens realizadas
por peritos.
Meios
O aluno disporá de um PC com o Matlab instalado.